MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f) plasmid pL2/434/Bu(f)

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021049	CTAGG	2	10	3	12	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021049	TAT	2	6	22	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021049	GTT	2	6	76	81	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021049	ATG	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021049	T	7	7	157	163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021049	TGAT	2	8	174	181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021049	AGA	2	6	253	258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021049	T	6	6	295	300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021049	GTT	2	6	344	349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021049	TCC	2	6	358	363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021049	A	6	6	375	380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021049	T	6	6	751	756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021049	T	6	6	1604	1609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021049	TAAA	2	8	1621	1628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021049	TA	3	6	4072	4077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021049	A	7	7	4077	4083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021049	AAC	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021049	ATT	2	6	4114	4119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021049	T	6	6	5170	5175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021049	GAATAT	2	12	5185	5196	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021049	AC	4	8	5267	5274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021049	CAA	2	6	6180	6185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021049	ACC	2	6	6207	6212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021049	ACC	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021049	ACC	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021049	ACC	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021049	TC	4	8	6291	6298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021049	AAATC	2	10	6302	6311	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021049	AT	6	12	6317	6328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021049	AT	5	10	6334	6343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021049	GGA	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021049	TCT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021049	TCT	2	6	7219	7224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021049	AAG	2	6	7227	7232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021049	GA	3	6	7242	7247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021049	CGA	2	6	7255	7260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021049	A	6	6	7271	7276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021049	TA	3	6	7308	7313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021049	ATC	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021049	TTC	3	9	7371	7379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021049	CCGA	2	8	7387	7394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021049	TAGAA	2	10	7425	7434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021049	AATT	2	8	7458	7465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021049	CAA	2	6	7475	7480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021049	CTT	2	6	7484	7489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.